ยาปฏิชีวนะมีผลเฉพาะทางเพศต่อการสร้างไมโครไบโอมในลำไส้ของหนูทดลองเพศผู้และเพศเมีย อาจมีผลต่อการใช้ยาในมนุษย์เพื่อรักษาหรือป้องกันการติดเชื้อแบคทีเรีย การให้ยาปฏิชีวนะหลายชนิดแก่หนูทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญและเฉพาะเพศทั้งในอุจจาระหรือลำไส้ใหญ่และลำไส้เล็ก การสูญเสียความหลากหลายของจุลินทรีย์ในอุจจาระและลำไส้เล็กมากขึ้น
การเปลี่ยนแปลงความหลากหลายของจุลินทรีย์ในลำไส้อาจส่งผลกระทบในทางลบ การศึกษาก่อนหน้านี้เกี่ยวกับสุขภาพของลำไส้ได้แสดงให้เห็นว่าความหลากหลายของจุลินทรีย์โดยรวมช่วยส่งเสริมความมีชีวิตชีวาและความยืดหยุ่น ซึ่งมักจะทำให้ลำไส้มีสุขภาพที่ดีขึ้น เปรียบเทียบองค์ประกอบของจุลินทรีย์ในลำไส้ของหนูเพศผู้และเพศเมียก่อน ระหว่าง และหลังการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะในวงกว้าง ซึ่งรวมถึง vancomycin, ampicillin เมโทรนิดาโซล และนีโอมัยซินเป็นระยะเวลาหนึ่งหลังจากที่หยุดใช้ยาปฏิชีวนะและพบว่ามีการเปลี่ยนแปลงเฉพาะเพศจำนวนมากที่เราสังเกตเห็นในระหว่างการรักษา กลุ่มดาวของจุลินทรีย์ในลำไส้ไม่กลับไปเป็นองค์ประกอบก่อนการใช้ยาปฏิชีวนะเดิมในเพศใดเพศหนึ่ง